Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HPRP00739 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HPRP00739 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPRP00739 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms