Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1AO95602 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms