Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TLX3O43711 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TLX3O43711 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TLX3O43711 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms