Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN25C9JDP6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms