Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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GGTLC3B5MD39 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GGTLC3B5MD39 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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