Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms