Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LYVE1Q9Y5Y7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms