Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX8Q9Y5X2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms