Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms