Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms