Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms