Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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MIS18AQ9NYP9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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MIS18AQ9NYP9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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MIS18AQ9NYP9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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MIS18AQ9NYP9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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MIS18AQ9NYP9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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MIS18AQ9NYP9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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