Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms