Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms