Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MID1IP1Q9NPA3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.9 ms