Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSU72Q9NP77 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSU72Q9NP77 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSU72Q9NP77 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSU72Q9NP77 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSU72Q9NP77 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms