Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL4Q9C0H6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms