Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms