Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOXF2Q9BQY4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms