Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms