Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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