Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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RNF185Q96GF1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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RNF185Q96GF1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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RNF185Q96GF1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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RNF185Q96GF1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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RNF185Q96GF1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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