Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms