Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD2Q96C19 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms