Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EME1Q96AY2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms