Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HGDQ93099 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HGDQ93099 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms