Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCDQ92629 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms