Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PHF3Q92576 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms