Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE22Q8NFJ8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms