Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SZRD1Q7Z422 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms