Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD2Q6Y1H2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms