Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RWDD4Q6NW29 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RWDD4Q6NW29 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RWDD4Q6NW29 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RWDD4Q6NW29 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms