Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms