Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TDRD12Q587J7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TDRD12Q587J7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms