Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFTN2Q52LD8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFTN2Q52LD8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms