Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SYPL1Q16563 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SYPL1Q16563 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SYPL1Q16563 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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