Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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RPE65Q16518 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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RPE65Q16518 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPE65Q16518 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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