Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TWIST1Q15672 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms