Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNHIT3Q15649 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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