Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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TAF1AQ15573 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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TAF1AQ15573 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TAF1AQ15573 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TAF1AQ15573 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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TAF1AQ15573 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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