Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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SIX1Q15475 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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SIX1Q15475 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SIX1Q15475 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SIX1Q15475 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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