Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms