Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOFQ13790 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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