Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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