Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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