Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LCP2Q13094 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms