Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB40BQ12829 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms