Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms