Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms