Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XPCQ01831 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XPCQ01831 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms